萬北遺址位于沭陽縣城北15公里，東距老沭河約2公里，現(xiàn)屬淮陰市沭陽縣萬匹鄉(xiāng)萬北村。1987年春南京博物院和淮陰市博物館在沭陽考古普查中發(fā)現(xiàn)。遺址范圍高出四周地表約2米，總面積達10萬平方米。

1987年至1988年南京博物院、淮陰市博物館曾對該遺址進行過試掘和兩期正式發(fā)掘，揭露面積500平方米。遺址文化堆積較厚，一般達3.5米左右，遺址包括有墓葬和灰坑。按時間階段的變化，該遺址文化堆積自下而上為新石器早期文化遺存、青蓮崗文化、大汶口文化和岳石文化遺存，還有商代晚期墓葬。

新石器時代早期文化遺存，放射性碳素斷代并經(jīng)校正的年代，為距今6540年左右。陶系以桔紅色的泥質(zhì)陶為主，夾砂陶次之，主要出土器物為泥質(zhì)陶缽和夾砂陶罐，以釜、罐為主要炊器，以手制為主，生產(chǎn)工具中石器少見，而漁獵用的骨器特別豐富，并有較多的骨針。地層中含有大量的貝殼。

青蓮崗文化遺存包括灰坑和幼兒墓葬，主要出土器物有鼎、壺、缽、罐等，器表盛行刻劃線紋，并伴出較多的內(nèi)彩陶片，彩飾以水波紋和網(wǎng)狀絲紋為主。該期缺乏石制生產(chǎn)工具而出有大量的骨制生產(chǎn)工具，并含有大量獸骨，經(jīng)鑒定有糜鹿、梅花鹿、豬、狗等，幼兒墓葬仰身直肢，陪葬內(nèi)彩陶缽和小口雙耳罐，陶缽覆蓋頭部。

大汶口文化遺存，包括有墓葬，出土陶器有鼎、豆、罐、盆、壺、盉、缽、鬶等，石器有斧、鏟、錛。內(nèi)部彩繪已不見，僅見外部繪彩陶器。時間上大體為大汶口文化中期花廳期相當。

岳石文化遺存，僅發(fā)現(xiàn)于遺址偏東的局部范圍，陶器以夾砂紅褐為主，灰陶次之，主要出土器物為尊、罐、杯、鬲、甗、蘑菇狀鈕蓋等，器物大多輪制，器壁厚、突棱發(fā)達。

商代晚期墓葬。皆東西向的豎穴淺坑墓，葬式仰身直肢，頭東向。發(fā)現(xiàn)具有腰坑的殉人墓，大多數(shù)為單人墓。隨葬品多數(shù)墓有銅兵器、生產(chǎn)工具以及陶器。陶器種類有鬲、甗、罐、豆、簋、觚等，有的則具有較強烈的地方性特征，一般素面或飾三角形刻劃圖案。

萬北遺址的發(fā)現(xiàn)和發(fā)掘為探討淮河下游的新石器時代文化類型提供了重要資料，并對研究商文化和東夷文化的關(guān)系提供了重要線索。

2011年12月19日，江蘇省人民政府將其公布為第七批省級文物保護單位。