黑龍江干岔子省級保護區(qū)成立于2011年，為內(nèi)陸濕地與水域類型自然保護區(qū)，重點保護對象為內(nèi)陸濕地與水域生態(tài)系統(tǒng)及珍稀野生動植物資源。保護區(qū)地處小興安嶺北麓的黑龍江省遜克縣境內(nèi)，東與遜克縣苗圃接壤，南以遜別拉河為界，西與孫吳縣相連，北與俄羅斯以黑龍江為界，地理坐標為：北緯49°24′54″～49°35′03″，東經(jīng)127°48′34″～128°18′59″，總面積26615 公頃，其中核心區(qū)面積9465公頃，占保護區(qū)面積的35.56%，緩沖區(qū)面積7894公頃，占保護區(qū)總面積的29.66%，實驗區(qū)面積9256公頃，占總面積的34.78%。
保護區(qū)有5個植被型，5個植被亞型，12個群系組，20個群系和32個群叢組或群叢。區(qū)內(nèi)共有高等植物658種，其中苔蘚植物19科34屬59種，蕨類植物10科13屬24種，種子植物80科274屬575種，包括野大豆、黃檗、鉆天柳、水曲柳和紫椴等國家Ⅱ級保護植物5種；有脊椎動物308種，其中魚類58種，兩棲類動物7種，爬行類動物9種，鳥類191種，哺乳類43種，包括東方白鸛、白頭鶴、金雕、丹頂鶴、紫貂等國家Ⅰ級保護野生動物5種和棕熊、猞猁、駝鹿、鴛鴦、花尾榛雞等國家Ⅱ級保護野生動物33種。
保護區(qū)與俄羅斯阿穆爾州級自然保護區(qū)隔江相望，是白頭鶴、東方白鸛等珍禽重要的棲息地，也是駝鹿、棕熊等大型獸類遷徙的重要通道。保護區(qū)生態(tài)系統(tǒng)類型保存完整，地理區(qū)位重要，景觀獨特，珍稀物種集中多樣，是集生物多樣性保護、科學研究、生態(tài)旅游和可持續(xù)利用于一體的自然保護區(qū)，也是中俄兩國跨境自然保護區(qū)建設(shè)重要的節(jié)點區(qū)域，具有極高的保護價值。