麗江市博物院位于麗江古城黑龍?zhí)豆珗@北部，是2004年由麗江東巴文化博物館與原麗江地區(qū)文物管理所合并組建的公益--業(yè)單位，肩負(fù)著收藏、整理、研究和宣傳歷史文物、傳承和弘揚(yáng)民族文化、保護(hù)管理麗江境內(nèi)文物等多重任務(wù)。人才結(jié)構(gòu)合理，具有良好的學(xué)術(shù)研究能力。博物院下設(shè)辦公室、陳列宣教部、保衛(wèi)部、文物保護(hù)管理部、產(chǎn)業(yè)開發(fā)部等部門。1993年被授予“全國(guó)十大地縣級(jí)優(yōu)秀博物館”稱號(hào)，1994年榮獲“全國(guó)文化先進(jìn)集體”稱號(hào)，1997年列為“云南省愛國(guó)主義教育基地”。
博物院主要設(shè)有四大展廳，第一展廳主要展示納西族起源，部分出土文物，東巴文化和東巴文化名家，三江并流及茶馬古道沙盤和麗江民族服飾。第二展廳主要展出東巴教相關(guān)的法器，東巴圣地名村，東巴占卜方式，及納西族傳統(tǒng)木楞房展示。第三展廳主要展示東巴象形文字、東巴造紙過程、東巴經(jīng)書在世界各地的收藏分布和納西東巴祭風(fēng)內(nèi)容和形式。第四展廳以前展出納西東巴教神路圖和東巴法器及藝術(shù)，現(xiàn)在因與省外博物館交流，故展出省外交流第的民族服飾服飾及文化。
博物院有一很大的四合院，院內(nèi)墻上市場(chǎng)展出麗江書畫名家作品。
每月第一個(gè)周和第三周的周一麗江市博物院閉關(guān)，其余時(shí)間開放。