靖江歷史上辦了不少書(shū)院，其中創(chuàng )辦最早、歷史最長(cháng)、影響最大的是馬洲書(shū)院。現今的馬洲書(shū)院坐落在靖江市第一中學(xué)內。
南宋建炎四年(1130年)，即靖江建縣前300多年，馬洲書(shū)院即已誕生，那是孔子51世孫孔元虔所建。孔元虔原住泰興，后遷居靖江西沙。他見(jiàn)那里沒(méi)有習讀場(chǎng)所，便自己出資在西沙孔家祖師堂附近建了一所書(shū)院，并以馬馱沙的別稱(chēng)“馬洲”命名。后來(lái)，馬洲書(shū)院湮沒(méi)，為何湮沒(méi)，無(wú)史料可考。明代崇幀九年(1636年)，陳函輝任靖江知縣。上任兩年后，他對靖江迎恩亭大加擴建，先在籬笆南面建一道牌坊，遁道而入，一邊栽梧桐，一邊種竹子，中間設柵門(mén)。進(jìn)入門(mén)內，有橋、有井；橋下是放生池。池東有石閘一座，啟動(dòng)閘門(mén)可引進(jìn)長(cháng)江的潮水。石閘之南建有一洞，橋的北面有屋5間。偏東有一閣，名“大士閣”。大士閣臨池而建，高20多公尺。登閣遠眺，城野山川，盡收眼底。循閣向西又有多幢建筑，包括一幢樓在內，計20余間，且皆以回廊相通。房屋四周，砌了圍墻，粉白的墻身配以黑色小瓦，莊重而又典雅。這是一所標準的書(shū)院。因為前人建過(guò)馬洲書(shū)院，為表示對前人的懷念和敬仰，陳函輝將此書(shū)院仍命名為“馬洲書(shū)院”。
未隔幾年，清兵入關(guān)，陳函輝苦心營(yíng)建的馬洲書(shū)院在戰火中化為廢墟。清代嘉慶十八年(1813年)江坍，陳函輝所建馬洲書(shū)院遺址全部坍入江中。此間，孔子后裔又在西沙流泅港永寧橋邊建了一所書(shū)院，也叫馬洲書(shū)院，不久亦毀。這樣，馬洲書(shū)院便三建三廢，成為歷史的遺憾。
清道光三十年(1850年)，賈益謙任靖江知縣，他得知馬洲書(shū)院的遭遇，不由感慨萬(wàn)端。懷著(zhù)對馬洲書(shū)院創(chuàng )建者的崇敬，他向上級呈文，要求將正誼書(shū)院改名為馬洲書(shū)院。正誼書(shū)院坐落南門(mén)城內(今靖城中學(xué))，為清乾隆十年(1745年)知縣楊逢泰所建。共有房屋17間，其中5間前廳、5間講堂、5間后廳、2間側廂。論其規模，自然不能與陳函輝所建的馬洲書(shū)院相比。清光緒三十一年(1905年)，政府明令廢科舉、辦學(xué)堂，這時(shí)由正誼書(shū)院改名的馬洲書(shū)院已不存在，縣府便在其舊址之上，創(chuàng )建了靖江縣高等小學(xué)堂。
靖江縣高等小學(xué)堂的主體建筑是一幢“口”字形的兩層樓房，式樣非常別致：：中間是正方形的天井，植以梧桐，又稱(chēng)梧桐廬。底層和上層皆以走廊環(huán)繞，穿堂入室，不必遭受雨淋日曬。因其與馬洲書(shū)院有著(zhù)一定的聯(lián)系，1983年被公布為縣級文物保護單位。1984年，樓房因年久失修，逐漸傾圮，靖城中學(xué)便報請縣政府同意，將其拆除，新建了一座水泥結構的仿宮殿式建筑，仍叫“馬洲書(shū)院”。它雖不是當年馬洲書(shū)院的修復，也不像“口”字形樓房具有古建筑特點(diǎn)和文物價(jià)值，但畢竟與馬洲書(shū)院的歷史有關(guān)，同樣值得珍視。