青墩遺址位于海安縣西北部約28公里處。
青墩遺址首次發(fā)現(xiàn)于1973年。1976年春，南通博物館在青墩采集、征集了一些出土遺物，其中不少屬于良渚文化的璧、琮、墜、環(huán)等玉器，十分珍貴。次年11月，該館又來青墩作小面積試掘。接著，南通博物院分別于1978年4—5月、1979年的4—5月，對(duì)青墩遺址進(jìn)行了面積達(dá)490平方米的大規(guī)模發(fā)掘。在青墩遺址出土的大批陶器中，有一枚堪稱“國寶”的有柄穿孔紅陶斧，按石斧實(shí)物仿制而成，分柄和穿孔斧兩部分。此陶斧并非實(shí)用之物，但為當(dāng)時(shí)穿孔石斧的裝柄方法提供了實(shí)物證據(jù)。陶斧的造型十分別致美觀。此外青墩遺址還出土了用鹿角制的耒和三叉形投擲器，這在江蘇系首次發(fā)現(xiàn)，具有重要的歷史考古價(jià)值。
從青墩遺址的文化遺存分析，盡管青墩遺址地處長江北岸，但總的文化面貌特征基本上與江南新石器時(shí)代遺存相類似，而與蘇北地區(qū)的有關(guān)新石器時(shí)代遺存區(qū)別較大。文化層的遺存在總的特征更接近于崧澤中層的文化遺存(崧澤文化距今約5800—5000年)，而上文化層的玉器等遺存則具有良渚文化的某些主要特征(良渚文化距今約5000—4000年)。
青墩遺址的發(fā)現(xiàn)對(duì)于探索長江南北新石器時(shí)代諸文化關(guān)系意義重大。2006年青墩遺址作為新石器時(shí)期的古遺址，被國務(wù)院列入第六批全國重點(diǎn)文物保護(hù)單位。