黃旗廟的建立，東莞有流傳甚廣的民間傳說(shuō)：江西省著(zhù)名的風(fēng)水先生賴(lài)布衣，為東莞勘察寶地。賴(lài)布衣來(lái)莞時(shí)，登山越嶺，不要說(shuō)皇帝、宰相的寶地，連狀元寶地也找不到。
一天清早，來(lái)到黃旗地帶，朦朧中覺(jué)得這是一塊出狀元的寶地，但中心穴點(diǎn)在哪里？總找不出來(lái)。正發(fā)愁時(shí)，忽見(jiàn)不遠處有一婦人穿白衣白褲，伏地作哭。賴(lài)布衣循聲上前一看，那婦人所伏地點(diǎn)，正是狀元地的穴口。
這婦人為何伏于此穴口？難道她懂風(fēng)水？賴(lài)布衣正要上前詢(xún)問(wèn)，忽然一陣風(fēng)吹來(lái)。賴(lài)布衣連忙合上雙眼。拭目看時(shí)，那婦人已經(jīng)不見(jiàn)。賴(lài)布衣方才明白，這婦女就是觀(guān)世音菩薩。賴(lài)布衣回去復命，人們聽(tīng)說(shuō)這是觀(guān)音顯靈的寶地，誰(shuí)敢爭奪？便在此建了觀(guān)音廟。黃旗古廟，應建于北宋徽宗時(shí)期。
廟內有一石匾：“寶安福地”。原因是隋代以，東莞地帶有寶山(在黃江)，因名寶安縣(包括今天的深圳市)。就是說(shuō)，黃旗觀(guān)音廟是今天東莞、深圳兩市人民的洞天福地。故每逢過(guò)年過(guò)節，這里香客如云。
黃旗廟經(jīng)歷代重修，從宋代至今保存完好，是東莞不可多得的名勝古跡。此外，黃旗古廟附近還有黃嶺道院、廉泉、廉泉亭、廉泉寺、黃嶺義冢、何仁山衣冠冢、陳應辰與青紫亭、游蛇墓等文物古跡。