卓爾庫特古城遺址位于輪臺縣城東南約25公里的克孜勒河西岸沼澤葦湖間，在倉頭古城遺址向東4公里處。古城是一個每邊長300余米的略圓城池，現(xiàn)已淪為一圈約3米高的土埂，由于靠近克孜勒河溝，城中和四周全為沼澤水溝。城中有一環(huán)形小湖，湖心高臺上有古建筑遺址。南面是兩個土坯，左面的似倉庫，右面的似官署遺址。東南角有一高約9米的土墩，似原來的戍保遺址。古城東西兩邊不遠處有兩座小黃土堆。各占地40平方米，一方一圓。是古城的附屬建筑再向東還有一小土墩，系舊時營壘。古城以西、以北的戈壁怪柳叢中、還能找到田埂、舊渠的殘跡和大小均勻、劃分整齊的田塊，是漢代“田卒”集體屯墾的紀實。
考古學(xué)家黃文弼曾在古城中挖出大量麥殼和陶片、箭鏃、勞動工具等文物，確認該遺址是漢昭帝時代(公元前86—前81)賴丹校尉修建的校尉城。
2019年，卓爾庫特古城遺址列入第八批全國重點文物保護單位。