南京清涼寺，始建于南朝，是中國佛教禪宗五家之一------法眼宗的發(fā)源地。法眼宗為南唐高僧文益禪師所創(chuàng)，其禪學思想在中國佛教史上具有崇高的地位和價值，影響遠及日本、韓國及東南亞，歷史意義十分深遠。
清涼山即因寺而得名。作為南唐首剎，鼎盛時期的清涼大道場是南京佛教傳統(tǒng)文化、清涼山精英文化、金陵地域文化的重要代表，“清涼問佛”更是流傳久遠的“金陵四十八景”之一。因而，在此國泰民安，佛法昌隆之際，恢復、重建這座千年古寺，不僅能滿足海內(nèi)外佛教徒禮拜祖庭，尋根問祖的心愿，找到法眼宗的“根”，重振法眼宗風，也有利于落實市委關(guān)于“整合佛教資源”的指示，填補鼓樓區(qū)沒有恢復寺院的歷史空白，對推進集自然、歷史、觀光、人文為一體的和諧都市發(fā)展有著不可估量的意義。
為此，南京市宗教局、南京市佛教協(xié)會與南京市園林局、清涼山公園管理處經(jīng)過協(xié)商，本著循序漸進的原則，于2009年1月將清涼寺原有的一座殿堂及五間瓦房交給佛教界，同年6月20日，舉行佛像開光，作為宗教活動場所正式對外開放。