下關(guān)火車(chē)站初稱(chēng)為滬寧鐵路南京車(chē)站，國民政府定都南京后，改稱(chēng)南京下關(guān)車(chē)站；汪偽時(shí)期，一度稱(chēng)為南京車(chē)站；1968年底，位于玄武湖北側的南京火車(chē)站建成后，更名為南京西站。
下關(guān)火車(chē)站初建于清光緒三十一年（1905年）。按當時(shí)統一規格“一等站屋”設計，有大小平房18間，建筑面積520平方米。有大廳、票房、電報房、站長(cháng)房、郵政房、貨物經(jīng)理人房等建筑設施。候車(chē)室僅有兩小間，木結構屋頂，屋面鋪蓋瓦楞白鐵皮。共有站臺三道，分別長(cháng)216米、229米和203米。1930年，國民政府鐵道部對車(chē)站進(jìn)行重建。重建的車(chē)站為中間3層、兩側2層的建筑，中部為橢圓形車(chē)站大廳，車(chē)站站臺上蓋有雨篷。1947年，國民政府對下關(guān)火車(chē)站進(jìn)行擴建。擴建工程由基泰工程司楊廷寶建筑師設計，徐順興營(yíng)造廠(chǎng)建造，當年完工。擴建后的車(chē)站，增建了一座呈“U”字形圍住原車(chē)站的大樓，南北兩翼為2層，正面為高架拱形大廳，門(mén)高15米。建筑全部采用鋼筋混凝土結構，面積1.87萬(wàn)平方米，可容納4000余名旅客候車(chē)。大廳南側設置行包房、售票處，還有檢票口及輔助出入口各1個(gè)；北側為貴賓室、郵件用房以及出入口。由于擴建施工逐段進(jìn)行，原有站房設備得到保留和利用，故對車(chē)站正常運營(yíng)無(wú)甚影響，并且節約了工程投資。1948年，又增建站臺1座。1949年，國民黨軍隊潰敗時(shí)，車(chē)站中央大廳遭到毀壞。新中國建立后，南京市人民政府重新修復，建成1800平方米的候車(chē)廳。2006年6月被列為市級文物保護單位。
1912年元月1日，孫中山由上海到南京就任中華民國臨時(shí)大總統，便是經(jīng)過(guò)下關(guān)火車(chē)站進(jìn)人南京城的。1946年6月23日，上海市各界群眾10余萬(wàn)人舉行反內戰、要和平的群眾大會(huì )，推選出以馬敘倫、胡厥文、閻寶航、雷潔瓊等9人為代表的上海人民和平--團，前來(lái)南京向國民政府--。當--團于當晚到達下關(guān)火車(chē)站時(shí)，擔任津浦鐵路調查統計室主任的中統特務(wù)頭子陳叔平，糾集一批暴徒，偽裝成蘇北難民，對--代表大打出手，毆傷包括代表團團長(cháng)馬敘倫在內的代表團成員多人。前往歡迎代表團的民盟代表葉篤義、現場(chǎng)采訪(fǎng)的《大公報》記者高集、《新民報》記者浦熙修也遭毒打，釀成了震驚世界的“下關(guān)慘案”。暴徒們行兇鬧事5個(gè)多小時(shí)后，軍警方才到車(chē)站維持秩序，用卡車(chē)將代表押往南京警備司令部。在代表強烈-及多方努力下，直到深夜，受傷代表才被送往中央醫院救治。正在南京與國民黨談判的中共代表團周恩來(lái)、董必武、鄧穎超聞?dòng)嵑螅辞巴t院慰問(wèn)，并向當局提出強烈-。