祁門(mén)縣博物館籌建于1986年10月，1988年6月工程竣工并投入使用，屬綜合性歷史博物館。1998年，因工作需要，祁門(mén)縣博物館與祁門(mén)縣文物管理所合并，一個(gè)機構兩塊牌子，名稱(chēng)為“祁門(mén)縣博物館”。
祁門(mén)縣博物館成立以來(lái)，充分發(fā)揮本地優(yōu)勢，通過(guò)考古發(fā)掘、調查征集、民間收購、野外采集等數十年的努力，具備了一定的文物收藏規模。到目前為止各類(lèi)藏品有12000余件（包括契約文書(shū)），內容涉及徽州契約文書(shū)、陶瓷、書(shū)畫(huà)、書(shū)籍、銅器、硯臺、印章、玉器、竹器、木器和近現代文物。其中尤以館藏特色文物——“徽州契約文書(shū)”最富特色，它記載和反映了明清至民國時(shí)期祁門(mén)人民的生產(chǎn)、生活中的各個(gè)方面，具有較強的地方歷史文化特色，為研究徽州歷史文化提供了寶貴的文字資料。
在做好館藏文物征集、保管和不可移動(dòng)文物保護管理工作的同時(shí)，本著(zhù)“有效保護、合理利用、加強管理”的原則，積極開(kāi)展富有地方特色及教育意義的專(zhuān)題展覽活動(dòng)，成為祁門(mén)縣青少年愛(ài)國主義教育基地和研究徽州政治、經(jīng)濟、民俗文化的科研基地。先后成功舉辦了“臺北故宮博物館書(shū)畫(huà)藏品展”、“祁門(mén)地方工業(yè)品展”、“祁門(mén)館藏文物暨民間收藏展”、“祁門(mén)縣館藏書(shū)畫(huà)展”、“館藏匾額暨民俗物品展”。受到省內外有關(guān)專(zhuān)家及廣大觀(guān)眾的一致好評。